RUDN Journal of Agronomy and Animal IndustriesRUDN Journal of Agronomy and Animal IndustriesВестник Российского университета дружбы народов. Серия: Агрономия и животноводство2312-797X2312-7988Peoples’ Friendship University of Russia named after Patrice Lumumba1952810.22363/2312-797X-2019-14-4-430-436Plant protectionЗащита растенийResearch ArticleMolecular identification of Ditylenchus destructor nematode with PCR Species-Specific primers in the Moscow regionМолекулярная идентификация нематоды Ditylenchus destructor методом полимеразной цепной реакции с использованием специфических праймеров в Московской областиMahmoudiNiloufarМахмудиНилоуфар

PhD candidate, Department of Agro-Biotechnology, Agrarian and Technological Institute

аспирант, агробиотехнологический департамент, Аграрно-технологический институт

niloofarmahmoodi@ymail.comNaserzadehYousefНасерзадеЮсеф

PhD candidate, Department of Agro-Biotechnology, Agrarian and Technological Institute

аспирант, агробиотехнологический департамент, Аграрно-технологический институт

unaserzadeh@gmail.comPakinaElena NПакинаЕлена Николаевна

PhD, Associate Professor, Department of Agro-Biotechnology, Agrarian and Technological Institute

кандидат биологических наук, доцент, агробиотехнологический департамент, Аграрнo-технологический институт

e-pakina@yandex.ruLimantcevaLiudmila AЛиманцеваЛюдмила Алексеевна

PhD, Senior scientist, Plant Quarantine Center

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник

Limantseva.ludmila@vniikr.ruNejadDavoud KartuliНеджадДавуд Картули

Assistant Professor of Forestry, Faculty of Desert Studies

доцент кафедры лесоводства, факультет исследований пустынь

Kartooli58@gmail.comPeoples’ Friendship University of Russia (RUDN University)Российский университет дружбы народовRussian Plant Quarantine Center (VNIIKR)Всероссийский центр карантина растений (ВНИИКР)Semnan UniversityУниверситет Семнан15122019144VOL 14, NO4 (2019)ТОМ 14, №4 (2019)43043629122019Copyright ©; 2019, Mahmoudi N., Naserzadeh Y., Pakina E.N., Limantceva L.A., Nejad D.K.Copyright ©; 2019, Махмуди Н., Насерзаде Ю., Пакина Е.Н., Лиманцева Л.А., Неджад Д.К.2019Mahmoudi N., Naserzadeh Y., Pakina E.N., Limantceva L.A., Nejad D.K.Махмуди Н., Насерзаде Ю., Пакина Е.Н., Лиманцева Л.А., Неджад Д.К.http://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://agrojournal.rudn.ru/agronomy/article/view/19528

Potato ( Solanum tuberosum L.) is one of the most vital food and industrial crop and Ditylenchus destructor is an influential pathogenic potato nematode and is quarantine pest in many states and territories. As a result, the polymerase chain reaction (PCR) protocol was optimized to identify Ditylenchus destructor reliably and rapidly. The species-specific internal transcribed spacer (ITS) was used as the primer of the D. destructor ribosomal DNA gene. Some populations of this species from the Moscow region in the Russian Federation were investigated through species-specific primer PCR. New sequence from ITS-rRNA was deposited in the GenBank under accession number MN122076. The current molecular technique is more appropriate to distinguishing of nematode species, since it is practical, fast and precise.

Картофель Solanum tuberosum L. - одна из наиболее важных продовольственных и технических культур, а Ditylenchus destructor является патогенной нематодой картофеля и числится в качестве карантинного вредного организма во многих странах и регионах. Поэтому был оптимизирован протокол полимеразной цепной реакции (ПЦР), который надежно и быстро идентифицирует деструктор Ditylenchus. Видоспецифичный внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) использовали в качестве праймера гена рибосомальной ДНК деструктора Ditylenchus. Некоторые популяции этого вида в Московской области были исследованы с помощью видоспецифического праймера ПЦР. Новая последовательность из ITS-рРНК была депонирована в GenBank под инвентарным номером MN122076. Современная молекулярная техника лучше подходит для различения видов нематод, поскольку она практична, быстра и точна.

PotatodiagnosisDitylenchus destructorPCR Species-SpecificnematodeITSDitylenchus destructorITSкартофельдиагностикавидоспецифический праймерполимеразная цепная реакциянематодавнутренний транскрибируемый спейсерLópez M, Riegel R, Lizana C, Behn A. Identification of virus and nematode resistance genes in the Chilota Potato Genebank of the Universidad Austral de Chile. Chilean journal of agricultural research. 2015; 75(3):320-327. doi: 10.4067/S0718-58392015000400008Scurrah MI, Niere B, Bridge J. Nematode parasites of solanum and sweet potatoes. In: Luc M, Sikora RA, Bridge J. (eds.) Plant parasitic nematodes in subtropical and tropical agriculture. 2nd ed. Wallingford, UK: CABI Publishing; 2005. p. 193-219. doi: 10.1079/9780851997278.0193Hijmans RJ. The effect of climate change on global potato production. American journal of potato research. 2003; 80(4):271-279. doi: 10.1007/BF02855363Nicol JM, Turner SJ, Coyne DL, Den Nijs L, Hockland S, Maafi ZT. Current nematode threats to world agriculture. In: Jones J, Gheysen G, Fenoll C. (eds.) Genomics and molecular genetics of plant-nematode interactions. Dordrecht: Springer; 2011. p. 21-43. doi: 10.1007/978-94-0070434-3_2Fortuner R. On the genus Dilylenchus Filipjev, 1936 (Nernatoda: Tylenchida). Revue Nematol. 1982; 5(1):17-38.Thorne G. Ditylenchus destructor n. sp. the potato rot nematode, and Ditylenchus dipsaci (Kühn, 1857) Filipjev, 1936, the teasel nematode (Nematoda: Tylenchidae). Proceedings of the helminthological Society of Washington. 1945; 12(2):27-34.Plowright RA, Caubel G, Mizen KA. Plant resistance to parasitic nematodes. In: Starr JL, Cook R, Bridge J. (eds.) Ditylenchus species. Wallingford, UK: CABI Publishing; 2002. p. 107- 139. doi: 10.1079/9780851994666.0107Hodda M, Nobbs J. A review of current knowledge on particular taxonomic features of the Australasian nematode fauna, with special emphasis on plant feeders. Australasian Plant Pathology. 2008; 37(3):308-317. doi: 10.1071/AP08024Kruus E. Impact of trade on distribution of potato rot nematode (Ditylenchus destructor) and other plant nematodes. Agronomy Research. 2012; 10(1-2):319-328.Powers TJARP. Nematode molecular diagnostics: from bands to barcodes. Annu Rev Phytopathol. 2004; 42:367-383. doi: 10.1146/annurev.phyto.42.040803.140348Naserzadeh Y, Kartoolinejad D, Mahmoudi N, Zargar M, Pakina E, Heydari M, Astarkhanova T, Kavhiza NJ. Nine strains of Pseudomonas fluorescens and P. putida: Effects on growth indices, seed and yield production of Carthamus tinctorius L. Research on Crops. 2018; 19(4):622- 632. doi: 10.31830/2348-7542.2018.0001.39Marek M, Zouhar M, Rysanek P, Havranek P. Analysis of ITS sequences of nuclear rDNA and development of a PCR-based assay for the rapid identification of the stem nematode Ditylenchus dipsaci (Nematoda: Anguinidae) in plant tissues. Helminthologia. 2005; 42(2):49-56.Esquibet M, Grenier E, Plantard O, Andaloussi FA, Caubel G. DNA polymorphism in the stem nematode Ditylenchus dipsaci: development of diagnostic markers for normal and giant races. Genome. 2003; 46(6):1077-1083. doi: 10.1139/g03-072Subbotin SA, Madani M, Krall E, Sturhan D, Moens M. Molecular diagnostics, taxonomy, and phylogeny of the stem nematode Ditylenchus dipsaci species complex based on the sequences of the internal transcribed spacer-rDNA. Phytopathology. 2005; 95(11):1308-1315. doi: 10.1094/PHYTO-95-1308Naserzadeh Y, Mahmoudi N. Chelating effect of black tea extract compared to citric acid in the process of the oxidation of sunflower, canola, olive, and tallow oils. International Journal of Agricultural and Biosystems Engineering. 2018; 12 (5): 5. doi: 10.13140/RG.2.2.12552.26887Fand BB, Amala U, Yadav D, Rathi G, Mhaske SH, Upadhyay A, et al. Bacterial volatiles from mealybug honeydew exhibit kairomonal activity toward solitary endoparasitoid Anagyrus dactylopii. Journal of Pest Science. 2019:1-12. doi: 10.1007/s10340-019-01150-4OEPP/EPPO. PM 7/87(2) Ditylenchus destructor and Ditylenchus dipsaci. Bulletin OEPP/ EPPO Bulletin. 2017; 47(3):401-419. doi: 10.1111/epp.12433Naserzadeh Y, Mahmoudi N, Pakina E. Antipathogenic effects of emulsion and nanoemulsion of cinnamon essential oil against Rhizopus rot and grey mold on strawberry fruits. Foods and Raw materials. 2019; 7(1):210-216. doi: 10.21603/2308-4057-2019-1-210-216