Отправить статью по E-mail 
Усовершенствование методов диагностики возбудителя бактериального ожога риса на основе ПЦР
- Авторы: Егорова М.С.1, Игнатов А.Н.2, Мазурин Е.С.1
-
Учреждения:
- ФГБУ Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
- Российский университет дружбы народов
- Выпуск: № 2 (2014)
- Страницы: 22-27
- Раздел: Статьи
- URL: https://agrojournal.rudn.ru/agronomy/article/view/1625
- DOI: https://doi.org/10.22363/2312-797X-2014-2-22-27
Цитировать
Полный текст
Аннотация
На основе анализа оригинальных и ранее опубликованных последовательностей ДНК Xanthomonas oryzae pv. oryzae были разработаны праймеры для ПЦР «в реальном времени», позволяющие достоверно идентифицировать возбудителя бактериального ожога риса, без перекрестных реакций с близкородственными видами. Была оптимизирована среда для БИО-ПЦР YPGA, содержащая в качестве селектирующих факторов антибиотики циклогексимид 50 мг/л + цефазолин 30 мг/л + гентамицин 2 мг/л. Показано, что чувствительность праймеров при БИО-ПЦР с использованием оригинальной селективной питательной среды в 100 раз эффективнее прямого ПЦР анализа. Оптимизированная БИО-ПЦР диагностика возбудителя бактериального ожога риса позволяла обнаружить 50 КОЕ/мл семенного экстракта.
Ключевые слова
Об авторах
Мария Сергеевна Егорова
ФГБУ Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Автор, ответственный за переписку.
Email: masha_0787@mail.ru
Александр Николаевич Игнатов
Российский университет дружбы народов
Email: an.ignatov@gmail.com
Кафедра ботаники, физиологии растений и агробиотехнологии
Евгений Сергеевич Мазурин
ФГБУ Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Email: zarauh@mail.ru
Список литературы
- Пунина Н.В., Зотов В.С., Кузнецов Б.Б., Игнатов А.Н. Оценка генетического разнообразия межгенного транскрибируемого региона 16S-23S рРНК, гена GYRB и разработка ПЦР диагностики фитопатогенных ксантомонад // Вестник Московского государственного областного университета. - 2008. - № 2. - С. 3-17.
- OEPP/EPPO. Data sheets on quarantine organisms, Xanthomonas oryzae // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. - 1990. - V. 16. - P. 1-8.
- OEPP/EPPO. Diagnostics, Xanthomonas oryzae // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. - 2007. - V. 37. - P. 543-553.
- Swings J.G., Van Den Mooter M., Vauterin L., Hoste B., Gillis M., Mew T.W. and Kersters K. Reclassification of the causal agents of bacterial blight Xanthomonas campestris pathovar oryzae and bacterial leaf streak Xanthomonas campestris pathovar oryzicola of rice as pathovars of Xanthomonas oryzae new species Ex Ishiyama // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1990. - V. 40. - P. 309-311.
- Yamamoto S., Bouvet P.J. and Harayama S. Phylogenetic structures of the genus Acinetobacter based on gyrB sequences: comparison with the grouping by DNA-DNA hybridization // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1999. - V. 49. - P. 87-95.
- Yamamoto S. and Harayama S. Phylogenetic analysis of Acinetobacter strains based on the nucleotide sequences of gyrB genes and on the amino acid sequences of their products // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1996. - V. 46. - P. 506-511.
- Zhao W.J., Zhu S.F., Liao X.L., Tan T.W. Detection of Xanthomonas oryzae pv. oryzae in seeds using a specifi c TaqMan probe // Molecular Biotechnology. - 2007. - V. 35. - P. 119-127.
