Неравномерная транскрипция генов в оперонах пластома ячменя

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Статья посвящена изучению транскрипции генов хлоропластных оперонов растений ячменя. Показано, что если опероны содержат гены, которые кодируют функционально сходные белки, то они транскрибируются равномерно при разных физиологических условиях. С другой стороны, опероны, включающие гены, продукты которых участвуют в разных метаболических путях или являются компонентами различных функциональных комплексов, могут иметь различную интенсивность транскрипции. Это говорит о возможности существования дополнительных путей посттранскрипционной регуляции экспрессии генов пластидных оперонов растений.

Об авторах

Анастасия Юрьевна Алейникова

Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Email: anastasia_ale@mail.ru
Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Виктор Васильевич Кузнецов

Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Email: vkusnetsov2001@rambler.ru
Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Ян Олегович Зубо

Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Email: yanzubo@gmail.com
Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Список литературы

  2. Liere K., Börner T. Transcription of plastid genes / Regulation of Transcription in Plants. - Grasser K.D. (ed.). - Blackwell Publishing Ltd., Oxford, 2006. - P. 184-224.
  3. Юрина Н.П., Одинцова М.С. Экспрессия генома хлоропластов и ее регуляция // Генетика. - 1991. - Т. 27. - С. 1125-1134.
  4. Юрина Н.П., Одинцова М.С. Сравнительная характеристика структурной организации генома хлоропластов и митохондрий растений // Генетика. - 1998. - Т. 34. - С. 5-22.
  5. Lerbs-Mache S. Function of plastid sigma factors in higher plants: regulation of gene expression or just preservation of constitutive transcription? // Plant Mol. Biol. - 2010. - Nov. 25. - E-pub ahead of print.
  6. Hajdukiewicz P.T.J., Allison L.A., Maliga P. The two RNA polymerases encoded by the nuclear and the plastid compartments transcribe distinct groups of genes in tobacco plastids // The EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16 - № 13. - P. 4041-4048.
  7. Hedtke B., Börner T., Weihe A. Mitochondrial and chloroplast phage-type RNA polymerases in Arabidopsis // Science. - 1997. - Vol. 277. - P. 809-811.
  8. Pfalz J., Liere K., Kandlbinder A., Dietz K.-J., Oelmüller R. pTAC2, -6 and -12 are components of the transcriptionally active plastid chromosome that are required for plastid gene expression // The Plant Cell. - 2006. - Vol. 18. - P. 176-197.
  9. Schweer J., Türkeri H., Kolpack A., Link G. Role and regulation of plastid sigma factors and their functional interactors during chloroplast transcription - recent lessons from Arabidopsis thaliana // Eur. J. Cell Biol. - 2010. - Vol. 89 (12). - P. 940-946.
  10. Schweer J., Türkeri H., Link B., Link G. AtSIG6, a plastid sigma factor from Arabidopsis, reveals functional impact of cpCK2 phosphorylation // Plant J. - 2010. - Vol. 62 (2). - P. 192-202.
  11. Zghidi W., Merendino L., Cottet A., Mache R., Lerbs-Mache S. Nucleus-encoded plastid sigma factor SIG3 transcribes specifically the psbN gene in plastids // Nucleic Acids Res. - 2007. - Vol. 35 (2). - P. 455-464.
  12. Hess W.R., Prombona A., Fieder B., Subramanian A.R., Börner T. Chloroplast rps15 and the rpoB/C1/C2 gene cluster are strongly transcribed in ribosome-deficient plastids: evidence for a functioning non-chloroplast-encoded RNA polymerase // The EMBO Journal. - 1993. - Vol. 12. - P. 563-571.
  13. Зубо Я.О., Кузнецов В.В. Применение метода run-on транскрипции для изучения регуляции экспрессии пластидного генома // Физиология растений. - 2008. - Т. 55. - № 1. - С. 114-122.
  14. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. - М.: Мир, 1984.
  15. Courtois F., Merendino L., Demarsy E., Mache R., Lerbs-Mache S. Phage-type RNA polymerase RPOTmp transcribes the rrn operon from the PC promoter at early developmental stages in Arabidopsis // Plant Physiol. - 2007. - Vol. 145 (3). - P. 712-721.
  16. Bligny M., Courtois F., Thaminy S., Chang C.C., Lagrange T., Baruah-Wolff J., Stern D., Lerbs-Mache S. Regulation of plastid rDNA transcription by interaction of CDF2 with two different RNA polymerases // EMBO J. - 2000. - Vol. 19 (8). - P. 1851-1860.
  17. Hübschmann T., Börner T. Characterization of transcript initiation sites in ribosome-deficient barley plastids // Plant Molecular Biology. - 1998. - Vol. 36. - P. 493-496.
  18. Krause K., Dieckmann C.L. Analysis of transcription asymmetries along the tRNAE-COB operon: evidence for transcription attenuation and rapid RNA degradation between coding sequences // Nucleic Acids Res. - 2004. - Vol. 32 (21). - P. 6276-6283.

© Алейникова А.Ю., Кузнецов В.В., Зубо Я.О., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах