Подбор комбинаций праймеров для определения межсортового и внутрисортового полиморфизма Glycine hispida
- Авторы: Романова Е.В.1, Кочумова А.А.2, Шмелькова Е.О.1
-
Учреждения:
- Российский университет дружбы народов
- Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
- Выпуск: № 2 (2015)
- Страницы: 16-23
- Раздел: Статьи
- URL: https://agrojournal.rudn.ru/agronomy/article/view/1348
- DOI: https://doi.org/10.22363/2312-797X-2015-2-16-23
Цитировать
Полный текст
Аннотация
В статье описан опыт подбора комбинаций праймеров для проведения AFLP-анализа внутрисортового и межсортового полиморфизма сортообразцов сои. В ходе опыта было протестированно 18 комбинаций праймеров, В результате отобрано 5 праймерных комбинаций, наиболее информативных для маркирования генома сои. Всего детектированно 132 AFLP-фрагмента, из которых 60 являлись полиморфными и характеризовали индивидуальные генотипы сортов.
Ключевые слова
Об авторах
Елена Валерьевна Романова
Российский университет дружбы народов
Автор, ответственный за переписку.
Email: evroma2008@yandex.ru
Кафедра генетики, растениеводства и защиты растений
Ая Арслановна Кочумова
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Email: aichka89@mail.ru
Лаборатория генетики растений
Екатерина Олеговна Шмелькова
Российский университет дружбы народов
Email: shmelkoffa@gmail.com
Кафедра генетики, растениеводства и защиты растений
Список литературы
- Гинс М.С. Изменение биохимического состава семян сои сортов Соната и Гармония при различных условиях выращивания / М.С. Гинс, О.А. Селихова, Е.А. Семенова, Л.Е. Иваченко, Е.В. Романова, С.Р.Е. Або Хегани // Доклады РАСХН. 2005. № 5. С. 10-12.
- Иваченко Л.Е. Ферменты как маркеры адаптации сои к условиям выращивания: монография. Благовещенск: Изд-во БГПУ, 2011.
- Конарев А.В. Адаптивный характер молекулярного полиморфизма и его использование в решении проблем генетических ресурсов растений и селекции // Аграрная Россия. 2002. № 3. С. 4-11.
- Левитес Е.В. Генетика изоферментов растений. Новосибирск: Наука. Сибирское отделение, 1986.
- Рамазанова С.А. Внутрисортовой полиморфизм сортов сои селекции ВНИИМК // Масличные культуры. Научно-технический бюллетень Всероссийского научно-исследовательского института масличных культур. 2009. № 2.
- Хавкин Э.Е. Молекулярная селекция растений: ДНК-технологии создания новых сортов сельскохозяйственных культур // Сельскохозяйственная биология. 2003. № 3. С. 28-41.
- Akkale C., Yildirim Z., Yildirim M.B., Kaya C., Ozturk G., Bahattin T. Assessing genetic diversity of some potato (Solanum tuberosum L.) genotypes grown in Turkey using the AFLP marker technique // Turkish J. Field Crops, 2010, 15(1): 73-78.
- Doyle J.J., Doyle J.L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochemical Bulletin. 1987. Vol. 19. P. 11-15.
- Fry NK1, Savelkoul PH, Visca P. Amplified fragment-length polymorphism analysis // Methods Mol. biol. 2009. 551:89-104.
- Fridovich I. Superoxide dismutases // Advances in Enzymology. 1986. V. 58. P. 61-97.
- Kim P., Leckman J.F., Mayes L.C., Feldman R., Wang X., Swain J.E. The plasticity of human maternal brain: Longitudinal changes in brain anatomy during the early postpartum period // Behavioral Neuroscience. 2010. 124: 695-700.
- Maughan P.J., Saghai Maroof M.A., Buss G.R., Huestis G.M. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) in soybean: species diversity, inheritance, and near-isogenic line analysis // Theor. Appl. Genet. 1996. 93. P. 392-401.
- Renganayaki K., Read J.C., Fritz A.K. Genetic diversity among Texas bluegrass genotypes (Poa arachnifera Torr.) revealed by AFLP and RAPD markers // Theor. Appl. Genet. 2001. 102: 1037-1045.
- Soleimani V.D., Baum B.R., Johnson D.A. Identification of Canadian durum wheat (Triticum turgidum L. subsp. durum (Desf) Husn.) cultivars using AFLP and their STS markers // Can. J. Plant Sci. 2002. 82: 35-41.
- Tumbilen Y., Frary A., Mutlu S., Doganlar S. Genetic diversity in Turkish egg- plant (Solanum melongena) varieties as determined by morphological and molecular analyses // Int. Res. J. Biotechnol. 2011. 2(1): 16-25.
- Vallejos C.E. Enzyme activity staining // Ysozymes in plant genetics and breeding. Part A. Amsterdam: Elsevier, 1983. Р. 469-515.
- Vos P. et al. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting // Nucleic Acids Res. 1995. 23. P. 4407-4414.
- Wang F., Li F., Wang J., Zhou Y., Sun H. Genetic diversity of the selected 64 potato germplasms revealed by AFLP markers // Mol. Plant Breed. 2011. l2(4): 22-29.