Исследование метода ПЦР в режиме «реального времени» для обнаружения и идентификации возбудителей фитоплазмозов винограда
- Авторы: Матяшова Г.Н.1, Заец В.Г.1
-
Учреждения:
- Российский университет дружбы народов
- Выпуск: № 4 (2015)
- Страницы: 7-14
- Раздел: Статьи
- URL: https://agrojournal.rudn.ru/agronomy/article/view/1505
- DOI: https://doi.org/10.22363/2312-797X-2015-4-7-14
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Для выявления и идентификации Candidatus Phytoplasma vitis Flavescence doree - возбудителя золотистого пожелтения винограда, карантинного вредного организма для территории России, и Candidatus Phytoplasma solani Bois noir - возбудителя почернения коры винограда был применен один из существующих методов диагностики ПЦР в режиме «реального времени» (ПЦР-РВ). Подобранные на участок 16SrRNA гена видоспецифичные праймерные системы исследовали на наличие ложноположительных и ложноотрицательных результатов для обнаружения в растительном материале двух вышеуказанных возбудителей фитоплазмозов. По результатам ПЦР в режиме «реального времени» было определено, что изучаемые пары праймеров позволяют выявлять целевые виды фитоплазм. Перекрестные реакции с другими видами фитоплазм не были зафиксированы. Пары праймеров не дают ложноположительных реакций с грамположительными бактериями и некоторыми видами бактерий микрофлоры винограда. Пары праймеров и соответствующие зонды FDrtF/R/FAM и BNrtF/R/FAM возможно использовать для обнаружения и идентификации фитоплазм - возбудителей болезней FD и BN в подкарантинном материале, а также при проведении мониторингов. Метод ПЦР-РВ считается достаточно простым в исполнении и не требует больших затрат времени для детекции результатов.
Ключевые слова
Об авторах
Галина Николаевна Матяшова
Российский университет дружбы народов
Автор, ответственный за переписку.
Email: nikitchenko@mail.ru
Агробиотехнологический департамент Аграрно-технологический институт; ФГБУ «Всероссийский центр карантина растений» ул. Пограничная, 32, пос. Быково, Раменский р-н, Московская обл., Россия, 140150
Владимир Григорьевич Заец
Российский университет дружбы народов
Email: nikitchenko@mail.ru
Агробиотехнологический департамент Аграрно-технологический институт
Список литературы
- Arnaud G., Malembic-Maher S., Salar P., Bonnet P., et al. Multilocus Sequence typing confirms the close genetic interrelatedness of three distinct Flavescence doree Phytoplasma strain clusters and group 16SrV Phytoplasmas infecting grapevine and alder in Europe // Applied and environmental microbiology. 2007. P. 4001-4010.
- Angelini E., Bianchi G.L., Filippin L., Morasutti C., Borgo M. A new TagMan method for the identification of phytoplasmas associated with grapevine yellows by real-time PCR assay // Journal of Microbiological methods. 2007. P. 613-622.
- Bertaccini A. Phytoplasmas: diversity, taxonomy and epidemiology // Frontiers in bioscience. 2006. P. 673-689.
- Chuche J., Thiery D. Biology and ecology of the Flavescence doree vector Scaphoideus titanus: a review // Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). 2014. P. 23.
- Hren M., Boben J., Kralj P., Gruden K., Ravnikar M. Real-time PCR detection systems for Flavescence doree and Bois noir phytoplasmas in grapevine: comparison with conventional PCR detection and application in diagnostics // Plant Pathology. 2007. P. 785-796.
- Lessio F., Tedeschi R., Alma A. Population dynamics, host plants and infection rate with Stolbur phytoplasma of Hyalesthes obsoletus Signoret in north-western Italy // Plant pathology. 2007. P. 97-102.
- Pelletier C., Salar P., Gillet J., Cloquemin G., et al. Triplex real-time PCR assay for sensitive and simultaneous detection of grapevine phytoplasmas of the 16SrV and 16SrXII-A groups with an endogenus analytical control. 2009. P. 87-95.
- Petrzik K., Sarkisova T., Curnova L. Universal primers for plasmid detection and method for their relative quantification in phytoplasma-infected plants // Bulletin of Insectology. 2011. P. 25-26.
- URL: www.vinocenter.ru.