Вклад консенсусной 5’-нетранслируемой области в эффективность трансляции гетерологичных генов в растительных клетках

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Результаты биоинформатического анализа позволили выявить следующую закономерность: средний размер 5’-нетранслируемой области (5'-НТО) для большинства генов A. thaliana с высоким уровнем экспрессии варьирует от 80 до 120 п. н. со средним содержанием GC 36,5%. На основании результатов выравнивания определена консенсусная 5'-НТО как новый регуляторный элемент, который потенциально может обеспечить высокоэффективную экспрессию и синтез целевого продукта в растениях. Эта последовательность имеет размер 87 п.н. и GC содержание 35,6%. Продемонстрировано, что консенсусная 5'-НТО обеспечивает увеличение накопления бирепортерного белка более, чем на 25%, тем самым выступает в качестве потенциального позитивного регуляторного элемента в эффективности трансляции.

Об авторах

Мариу Гилерме Кимиссе

Российский университет дружбы народов

Автор, ответственный за переписку.
Email: kimisse@rambler.ru

Кафедра ботаники, физиологии растений и агробиотехнологии

Ксения Владимировна Кабардаева

РГАУ - МСХА имени К.А. Тимирязева

Email: kabardaewa@yandex.ru

Ольга Алексеевна Гра

ФГБУН Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Email: olgagra@gmail.com

Александр Александрович Тюрин

ФГБУН Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН

Email: alexjofar@gmail.com

Список литературы

  1. Вячеславова А.О. Серия модульных векторов для стабильной и транзиентной экспрессии гетерологичных генов в растениях / А.О. Вячеславова, О.Н. Мустафаев, А.А. Тюрин, Х.Р. Шимшилашвили, И.Н. Бердичевец, Д.М. Шаяхметова, М.А. Голденков, В.С. Фадеев, Ю.В. Шелудько, И.В. Голденкова-Павлова // Генетика. 2012. Т. 48. № 9. С. 1046-1056.
  2. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984.
  3. Bradford M.A. Rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Analytical Biochemistry. 1976. Vol. 72. P. 248-254.
  4. Calvo S.E., Pagliarini D.J., Mootha V.K. Upstream open reading frames cause wide spread reduction of protein expression and are polymorphic among humans // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009. Vol. 106. P. 7507-7512.
  5. Iacono M., Mignone F., Pesole G. uAUG and uORFs in human and rodent 5′untranslated mRNAs // Gene. 2005. Vol. 349. P. 97-105.
  6. Kozak M. Downstream secondary structure facilitates recognition of initiator codons by eukaryotic ribosomes // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1990. Vol. 87. P. 8301-8305.
  7. Kozak M. Point mutations close to the AUG initiator codon affect the efficiency of translation of rat preproinsulin in vivo // Nature. 1984. Vol. 308. P. 241-246.
  8. Kozak M. Point mutations define a sequence flanking the AUG initiator codon that modulates translatin by eukaryotic ribosomes // Cell. 1986. Vol. 44. P. 283-292.
  9. Mann D.G.J., King Z.R., Liu W., Joyce B.L., Percifield R.J., Hawkins J.S., LaFayette P.R., Artelt B.J., Burris J.N., Mazarei M., Bennetzen J.L., Parrott W.A., Neal Stewart C.J. Switchgrass (Panicum virgatum L.) polyubiquitin gene (PvUbi1 and PvUbi2) promoters for use in plant transformation // BMC Biotechnol. 2011. Vol. 11. № 11. P. 74.
  10. Masura S.S., Ahmad P.G.K., Ti L.L.E. Isolation and characterization of an oil palm constitutive promoter derived from a translationally control tumor protein (TCTP) gene // Plant Physiology and Biochemistry. 2011. Vol. 49. P. 701-708.
  11. Park S.H., Yi N., Kim Y.S., Jeong M.H., Bang S. W, Choi Y.D., Kim J.K. Analysis of five novel putative constitutive gene promoters in transgenic rice plants // Journal of Experimental Botany. 2010. Vol. 61. № 9. P. 2459-2467.
  12. Pelletier J., Sonenberg N.J. Insertion mutagenesis to increase secondary structure within the 5′ noncoding region of a eukaryotic mRNA reduces translational efficiency // Cell. 1985. Vol. 40. P. 515-526.
  13. Wood T.M., Bhat K.M. Methods for measuring cellulase activities // Methods in Enzymology. 1988. Vol. 160. P. 87-112.

© Кимиссе М.Г., Кабардаева К.В., Гра О.А., Тюрин А.А., 2015

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах