Идентификация Drosophila melanogaster методом полимеразной цепной реакции

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

D. melanogaster - одна из наиболее вредоносных плодовых мух, повреждающих цитрусовые и многие другие сельскохозяйственные растения. Молекулярный метод диагностики был создан для идентификации D. melanogaster от другого некарантинного вида Drosophila spp. Предложенный метод дифференциации заключается в использовании фрагмента гена цитохромоксидазы субъединицы 1 митохондриальной ДНК размером 709 п. н. С помощью праймеров Droso-S391 и Droso-A381 были амплифицированы образцы ДНК D. melanogaster, D. suzukii и D. Simulans в лабораторных образцах из разных стран, далее их сравнили с последовательностями других таксонов Drosophila из базы GenBank. Результаты проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) на основе полиморфизма нуклеотидных последовательностей показали, что данные праймеры точно идентифицируют участок гена, также как и специфические праймеры Drosophila melanogaster.

Об авторах

Юсеф Насерзаде

Российский университет дружбы народов; Всероссийский центр карантина растений

Автор, ответственный за переписку.
Email: unaserzadeh@gmail.com

научный сотрудник агробиотехнологического департамента, Аграрно-технологический институт

г. Москва, Российская Федерация; Московская область, Российская Федерация

Елена Николаевна Пакина

Российский университет дружбы народов

Email: e-pakina@yandex.ru

кандидат биологических наук, доцент, агробиотехнологический департамент, Аграрно-технологический институт

г. Москва, Российская Федерация

Абдорреза Мохаммади Нафчи

Научный университет Малайзии

Email: amohammadi@usm.my

профессор

Пенанг, Малайзия

Анвар Шихрагимович Гаджикурбанов

Российский университет дружбы народов

Email: gadcgikurbanow@mail.ru

агроинженерный департамент, Аграрно-технологический институт

г. Москва, Российская Федерация

Список литературы

  1. Asplen MK, Anfora G, Biondi A, Choi DS, Chu D, Daane KM, et al. Invasion biology of spotted wing Drosophila (Drosophila suzukii): a global perspective and future priorities. Journal of Pest Science. 2015; 88(3):469-494. doi: 10.1007/s10340-015-0681-z
  2. Kanzawa T. Studies on Drosophila suzukii mats. Kofu: Yamanashi Agricultural Experimental Station; 1939.
  3. Burrack HJ, Fernandez GE, Spivey T, Kraus DA. Variation in selection and utilization of host crops in the field and laboratory by Drosophila suzukii Matsumara (Diptera: Drosophilidae), an invasive frugivore. Pest Management Science. 2013; 69(10):1173-1180. doi: 10.1002/ps.3489
  4. Parchami-Araghi M, Pont AC, Gilasian E, Basavand F, Mousavi H. First Palaearctic record of the genus Pygophora Schiner, 1868 (Diptera: Muscidae) from Iranian Baluchestan. Zoology in the Middle East. 2017; 63(3):280-282. doi: 10.1080/09397140.2017.1331589
  5. Naserzadeh Y, Mahmoudi N, Pakina E, Wase M, Anne I, Heydari M, et al. Parameters Affecting the Biosynthesis of Gold Nanoparticles Using the Aquatic Extract of Scrophularia striata and their Antibacterial Properties. Journal of Nanoanalysis. 2019; 6(2):105-114. doi: 10.22034/JNA.2019.667091
  6. Mans DR, Sairras S, Ganga D, Kartopawiro J. Exploring the global animal biodiversity in the search for new drugs-insects. J Transl Sci. 2016; 3(1):371-386. doi: 10.15761/JTS.1000164
  7. Walsh DB, Bolda MP, Goodhue RE, Dreves AJ, Lee J, Bruck DJ, et al. Drosophila suzukii (Diptera: Drosophilidae): invasive pest of ripening soft fruit expanding its geographic range and damage potential. Journal of Integrated Pest Management. 2011; 2(1): G1-G7. doi: 10.1603/IPM10010
  8. Nikolouli K, Colinet H, Renault D, Enriquez T, Mouton L, Gibert P, et al. Sterile insect technique and Wolbachia symbiosis as potential tools for the control of the invasive species Drosophila suzukii. Journal of pest science. 2018; 91(2):489-503. doi: 10.1007/s10340-017-0944-y
  9. Rota-Stabelli O, Ometto L, Tait G, Ghirotto S, Kaur R, Drago F, et al. Distinct genotypes and phenotypes in European and American strains of Drosophila suzukii: implications for biology and management of an invasive organism. Journal of Pest Science. 2020; 93(1):77-89. doi: 10.1007/s10340-019-01172-y
  10. Diepenbrock LM, Burrack HJ. Variation of within crop microhabitat use by Drosophila suzukii (Diptera: Drosophilidae) in blackberry. Journal of Applied Entomology. 2016; 141(1-2):1-7. doi: 10.1111/jen.12335
  11. Poyet M, Eslin P, Héraude M, Le Roux V, Prévost G, Gibert P, et al. Invasive host for invasive pest: when the Asiatic cherry fly (Drosophila suzukii) meets the American black cherry (Prunus serotina) in Europe. Agricultural and forest entomology. 2014; 16(3):251-259. doi: 10.1111/afe.12052
  12. Correa SC, Wille CL, Hoffer H, Boff MI, Franco CR. Oviposition preference and biology of fruit fl es (Diptera: Tephritidae) on grape vine genotypes. Revista Caatinga. 2018; 31(4):850-859. doi: 10.1590/1983-21252018v31n407rc
  13. Hauser M. A historic account of the invasion of Drosophila suzukii (Matsumura) (Diptera: Drosophilidae) in the continental United States, with remarks on their identification. Pest management science. 2011; 67(11):1352- 1357. doi: 10.1002/ps.2265
  14. Landolt PJ, Adams T, Rogg H. Trapping spotted wing drosophila, Drosophila suzukii (Matsumura) (Diptera: Drosophilidae), with combinations of vinegar and wine, and acetic acid and ethanol. Journal of Applied Entomology. 2012; 136(1-2):148-154. doi: 10.1111/j.1439-0418.2011.01646.x
  15. Nestel D, Nemny-Lavy E, Chang CL. Lipid and protein loads in pupating larvae and emerging adults as affected by the composition of Mediterranean fruit fly (Ceratitis capitata) meridic larval diets. Archives of Insect Biochemistry and Physiology. 2004; 56(3):97-109. doi: 10.1002/arch.20000
  16. Chang CL. Effect of amino acids on larvae and adults of Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae). Annals of the Entomological Society of America. 2004; 97(3):529-535. doi: 10.1603/0013-8746(2004)097[0529: EOAAOL]2.0.CO;2
  17. Rashid MA, Andongma AA, Dong YC, Ren XM, Niu CY. Effect of gut bacteria on fitness of the Chinese citrus fl , Bactrocera minax (Diptera: Tephritidae). Symbiosis. 2018; 76(1):63-69. doi: 10.1007/s13199-018-0537-4
  18. Green L, Battlay P, Fournier-Level A, Good RT, Robin C. Cisand trans-acting variants contribute to survivorship in a naïve Drosophila melanogaster population exposed to ryanoid insecticides. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2019; 116(21):10424-10429. doi: 10.1073/pnas.1821713116
  19. Lachaise D, Cariou ML, David JR, Lemeunier F, Tsacas L, Ashburner M. Historical biogeography of the Drosophila melanogaster species subgroup. In: Hecht MK, Wallace B, Prance GT. (eds). Evolutionary biology. Boston, MA: Springer; 1988. p.159-225. doi: 10.1007/978-1-4613-0931-4_4
  20. Lee CH, Rimesso G, Reynolds DM, Cai J, Baker NE. Whole-genome sequencing and iPLEX MassARRAY genotyping map an EMS-induced mutation affecting cell competition in Drosophila melanogaster. G3: Genes, Genomes, Genetics. 2016; 6(10):3207-3217. doi: 10.1534/g3.116.029421
  21. Lillesaar C, Gaspar P. Serotonergic Neurons in Vertebrate and Invertebrate Model Organisms (Rodents, Zebrafish, Drosophila melanogaster, Aplysia californica, Caenorhabditis elegans). In: Pilowsky PM. (ed.) Serotonin. Academic Press; 2019. p.49-80. doi: 10.1016/B978-0-12-800050-2.00003-6
  22. Lynch ZR, Schlenke TA, de Roode JC. Evolution of behavioural and cellular defences against parasitoid wasps in the Drosophila melanogaster subgroup. Journal of Evolutionary Biology. 2016; 29(5):1016-1029. doi: 10.5061/dryad.5t5m4
  23. Mahmoudi N, Naserzadeh Y, Pakina EN, Limantceva LA, Nejad DK. Molecular identifi of Ditylenchus destructor nematode with PCR Species-Specific primers in the Moscow region. RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries. 2019; 14(4):430-436. doi: 10.22363/2312-797X-2019-14-4-430-436
  24. Melcarne C, Ramond E, Dudzic J, Bretscher AJ, Kurucz É, Andó I, et al. Two Nimrod receptors, NimC1 and Eater, synergistically contribute to bacterial phagocytosis in Drosophila melanogaster. The FEBS Journal. 2019; 286(14):2670-2691. doi.org/10.1111/febs.14857
  25. Naserzadeh Y, Kartoolinejad D, Mahmoudi N, Zargar M, Pakina E, Heydari M, et al. Nine strains of Pseudomonas fluorescens and P. putida: Effects on growth indices, seed and yield production of Carthamus tinctorius L. Research on Crops. 2018; 19(4):622-632. doi: 10.31830/2348-7542.2018.0001.39
  26. Naserzadeh Y, Nafchi AM, Mahmoudi N, Nejad DK, Gadzhikurbanov ASh. Effect of combined use of fertilizer and plant growth stimulating bacteria Rhizobium, Azospirillum, Azotobacter and Pseudomonas on the quality and components of corn forage in Iran. RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries. 2019; 14(3):209-224. doi: 10.22363/2312-797X-2019-14-3-209-224
  27. Yassin A, Debat V, Bastide H, Gidaszewski N, David JR, Pool JE. Recurrent specialization on a toxic fruit in an island Drosophila population. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2016; 113(17):4771-4776. doi: 10.1073/pnas.1522559113
  28. Naserzadeh Y, Mahmoudi N, Pakina E. Antipathogenic effects of emulsion and nanoemulsion of cinnamon essential oil against Rhizopus rot and grey mold on strawberry fruits. Foods and Raw Materials. 2019; 7(1):210- 216. doi: 10.21603/2308-4057-2019-1-210-216.

© Насерзаде Ю., Пакина Е.Н., Нафчи А.М., Гаджикурбанов А.Ш., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах